Одним из приоритетных направлений развития в республике, обеспечивающих ее конкурентоспособность, является структурная диверсификация экономики на основе инновационного технологического развития.

Обеспечение инновационной деятельности планируется через реализацию долгосрочной целевой программы «Государственная поддержка инновационной деятельности в Республике Карелия на период 2011-2015 годов», а также разрабатываемого закона Республики Карелия «Государственная поддержка инновационной деятельности в Республике Карелия».

Подробная информация об инновационной деятельности в Республике Карелия представлена на Официальном портале органов государственной власти Республики Карелия, где ведется в режиме On-Lain 9 информационных подразделов.

Региональная инновационная система республики создается на базе некоторых уже существующих структурных элементов, а также имеющегося научного и кадрового потенциала. Государственная инновационная политика в регионе основывается на формах поддержки, которые включают в себя формирование и совершенствование нормативной правовой базы государственное финансирование, информационное обеспечение, развитие инфраструктуры, подготовку и поиск кадров.

В Республике Карелия созданы основные элементы инновационной инфраструктуры: Региональный инновационный комплекс и IT-парк Петрозаводского Государственного университета, Инновационный центр «Укко» и Карельский центр трансфера технологий и инноваций при КарНЦ РАН, Бизнес-инкубатор Республики Карелия, факультет технологии Карельского государственного педагогического университета, функционируют несколько инновационноактивных предприятий. Существует сайт, обеспечивающий двусторонний контакт потребителя и производителя новых технологий http://ckp.petrsu.ru

Число инфраструктурных элементов инновационной системы составляет более трех десятков и является в настоящий момент достаточным для республики. Однако следует отметить, что работа многих из них могла бы быть более активной при наличии финансовой поддержки их работы со стороны государства и частных инвесторов.

Научный потенциал Республики Карелия представлен в основном академический наукой. В Петрозаводске функционирует Карельский научный центр Российской академии наук (КарНЦ РАН). В его составе - 7 академических институтов. Фундаментальные научные исследования составляют более 80% от всех проводимых в КарНЦ РАН исследований. Прикладными исследования занимаются в основном преподаватели и аспиранты Петрозаводского государственного университета - крупнейшего регионального ВУЗа на Северо-Западе России. Научные исследования осуществляются и в лабораториях Карельской государственной педагогической академии.

Для формирования и развития системы подготовки, переподготовки и повышения квалификации специалистов в сфере инновационной деятельности в Петрозаводском государственном университете, Карельской государственной педагогической академии осуществляются и расширяются учебные планы по подготовке специалистов в инновационной сфере. КарНЦ РАН проводит подготовку специалистов в целевой аспирантуре по современным инновационным направлениям – биотехнологии, химической технологии и другим дисциплинам.

Основные данные по научному потенциалу Карелии:

В целях внедрения передовых технологий и инноваций оказывается помощь в приобретении высокотехнологичного оборудования как за счет Гарантийного фонда, так и за счет предоставления субсидий и грантов. Органами государственной власти планируется усиление деятельности по демонстрации передовых отечественных и зарубежных технологий в производственной  и социальной сферах. За счет показов на выставочных мероприятиях создаваемых в Республике Карелия технологий планируется привлечение заказчиков и инвесторов для их развития. 

Важной формой привлечения средств на финансирование и реализацию инновационных проектов является взаимодействие с государственными научными фондами (Российский фонд фундаментальных исследований, Российский гуманитарный научный фонд, фонд содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере (фонд Бортника), «Зворыкинский проект» и др.), а также с частными венчурными фондами и центрами. Имеющиеся в настоящее время соглашения между Правительством Республики Карелия  и рядом фондов позволяют привлекать финансовые средства для развития инновационных проектов.

Большое значение придаётся организации выставочной деятельности за пределами республики, которая обеспечивает не только установление партнерских отношений между разработчиками инновационной продукции, но и позволяет находить потребителей инновационной продукции. Ежегодно организуется участие карельских инновационных предприятий и научных коллективов в 3-5 всероссийских и международных выставках.

Основные показатели реализации инновационной деятельности

К 2015 году за счет прироста инновационных предприятий, а также интенсификации работы действующих инновационных предприятий доля объема производства инновационной продукции должна увеличиться в 3 раза и достигнуть среднероссийского уровня. Количество научных разработок и проектов, подготовленных к коммерциализации, и количество полученных патентов возрастет в два раза.